Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOP08100 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOP08100 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHOP08100 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHOP08100 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOP08100 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOP08100 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOP08100 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOP08100 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHOP08100 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOP08100 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOP08100 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOP08100 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOP08100 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOP08100 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHOP08100 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHOP08100 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RHOP08100 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RHOP08100 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RHOP08100 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms