Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPM2P07951 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPM2P07951 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM2P07951 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM2P07951 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM2P07951 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM2P07951 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM2P07951 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM2P07951 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM2P07951 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPM2P07951 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPM2P07951 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPM2P07951 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPM2P07951 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPM2P07951 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPM2P07951 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPM2P07951 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPM2P07951 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPM2P07951 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms