Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CENPBP07199 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CENPBP07199 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CENPBP07199 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CENPBP07199 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CENPBP07199 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CENPBP07199 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CENPBP07199 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CENPBP07199 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CENPBP07199 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CENPBP07199 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CENPBP07199 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CENPBP07199 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CENPBP07199 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CENPBP07199 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPBP07199 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPBP07199 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPBP07199 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPBP07199 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPBP07199 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CENPBP07199 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CENPBP07199 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CENPBP07199 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CENPBP07199 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CENPBP07199 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CENPBP07199 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CENPBP07199 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CENPBP07199 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CENPBP07199 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CENPBP07199 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CENPBP07199 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CENPBP07199 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CENPBP07199 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CENPBP07199 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CENPBP07199 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CENPBP07199 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CENPBP07199 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CENPBP07199 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CENPBP07199 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CENPBP07199 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CENPBP07199 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CENPBP07199 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CENPBP07199 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CENPBP07199 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CENPBP07199 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CENPBP07199 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms