Protein–RNA interactions for Protein: P06858

LPL, Lipoprotein lipase, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPLP06858 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LPLP06858 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPLP06858 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPLP06858 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPLP06858 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPLP06858 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPLP06858 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPLP06858 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LPLP06858 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LPLP06858 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LPLP06858 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPLP06858 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPLP06858 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPLP06858 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms