Protein–RNA interactions for Protein: P05813

CRYBA1, Beta-crystallin A3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA1P05813 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CRYBA1P05813 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CRYBA1P05813 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms