Protein–RNA interactions for Protein: P02778

CXCL10, C-X-C motif chemokine 10, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL10P02778 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXCL10P02778 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXCL10P02778 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms