Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C1RP00736 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1RP00736 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1RP00736 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C1RP00736 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1RP00736 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1RP00736 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1RP00736 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1RP00736 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C1RP00736 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C1RP00736 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1RP00736 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C1RP00736 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1RP00736 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C1RP00736 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1RP00736 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C1RP00736 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1RP00736 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1RP00736 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1RP00736 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1RP00736 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1RP00736 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1RP00736 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms