Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL18O94889 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL18O94889 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL18O94889 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL18O94889 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL18O94889 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL18O94889 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL18O94889 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL18O94889 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL18O94889 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL18O94889 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL18O94889 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL18O94889 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL18O94889 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL18O94889 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL18O94889 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL18O94889 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL18O94889 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL18O94889 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL18O94889 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL18O94889 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL18O94889 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms