Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NPM3O75607 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NPM3O75607 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NPM3O75607 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NPM3O75607 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NPM3O75607 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM3O75607 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM3O75607 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM3O75607 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM3O75607 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM3O75607 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM3O75607 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM3O75607 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM3O75607 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM3O75607 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms