Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC44.94■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC44.89■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC44.89■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCC9O60706 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ABCC9O60706 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC44.81■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC44.81■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
ABCC9O60706 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms