Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KIAA0556O60303 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KIAA0556O60303 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KIAA0556O60303 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms