Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SOX15O60248 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SOX15O60248 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SOX15O60248 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SOX15O60248 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX15O60248 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX15O60248 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX15O60248 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX15O60248 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX15O60248 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX15O60248 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX15O60248 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOX15O60248 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms