Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYO1BO43795 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1BO43795 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1BO43795 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms