Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ3O43525 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ3O43525 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
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