Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA2O43364 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA2O43364 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms