Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN3O15551 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN3O15551 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms