Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC01565O15544 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC01565O15544 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC01565O15544 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms