Protein–RNA interactions for Protein: O15067

PFAS, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFASO15067 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFASO15067 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PFASO15067 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PFASO15067 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PFASO15067 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PFASO15067 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PFASO15067 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PFASO15067 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFASO15067 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFASO15067 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFASO15067 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFASO15067 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFASO15067 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFASO15067 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PFASO15067 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFASO15067 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFASO15067 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFASO15067 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFASO15067 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFASO15067 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFASO15067 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFASO15067 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PFASO15067 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFASO15067 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFASO15067 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFASO15067 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFASO15067 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PFASO15067 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFASO15067 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PFASO15067 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PFASO15067 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PFASO15067 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PFASO15067 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PFASO15067 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PFASO15067 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFASO15067 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFASO15067 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFASO15067 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFASO15067 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFASO15067 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFASO15067 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PFASO15067 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms