Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA3EO15041 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3EO15041 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms