Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAFD1O14545 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAFD1O14545 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
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