Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGRNO00468 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AGRNO00468 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AGRNO00468 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AGRNO00468 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AGRNO00468 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AGRNO00468 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AGRNO00468 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AGRNO00468 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AGRNO00468 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms