Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLRMTO00411 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLRMTO00411 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLRMTO00411 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms