Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NFKBIEO00221 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFKBIEO00221 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms