Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
J3QR89 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
J3QR89 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
J3QR89 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
J3QR89 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3QR89 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3QR89 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3QR89 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms