Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9PBE3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PBE3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PBE3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PBE3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PBE3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9PBE3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9PBE3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9PBE3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9PBE3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9PBE3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
E9PBE3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PBE3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PBE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PBE3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PBE3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PBE3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9PBE3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E9PBE3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E9PBE3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E9PBE3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E9PBE3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E9PBE3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E9PBE3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E9PBE3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms