Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF487B1APH4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF487B1APH4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms