Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COLCA2A8K830 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
COLCA2A8K830 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms