Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCNX2A6NKB5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCNX2A6NKB5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms