Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L4A6NEF3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms