Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VWA8A3KMH1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VWA8A3KMH1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms