Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CASP4P49662 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CASP4P49662 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CASP4P49662 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CASP4P49662 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASP4P49662 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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