Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPOP42166 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AHCYP7-201ENST00000560847 1308 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TRIM39-RPP21-201ENST00000623385 1698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPOP42166 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPOP42166 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms