Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 CLASP2-201ENST00000313350 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 GAGE10-201ENST00000407599 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 B2M-202ENST00000544417 933 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC090236.1-201ENST00000590318 768 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC244517.2-204ENST00000624802 415 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC127537.3-201ENST00000566532 749 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SC5D-208ENST00000534230 1861 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 PSORS1C2-201ENST00000259845 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC019185.2-201ENST00000424628 520 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC073472.1-201ENST00000441433 803 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AP000926.2-201ENST00000469983 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC121247.1-201ENST00000622888 1232 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ETV7-208ENST00000627426 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 LIPC-202ENST00000356113 2161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC240565.1-201ENST00000624936 1373 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 OR9G1-201ENST00000312153 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P34-201ENST00000391992 950 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ITPKB-IT1-201ENST00000412918 746 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AL121761.1-203ENST00000426012 677 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SLC39A9-210ENST00000557046 855 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 RN7SL644P-201ENST00000577919 259 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AP4S1-203ENST00000334725 1122 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ALG1L10P-201ENST00000437882 424 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 RN7SL771P-201ENST00000482328 298 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.76-201ENST00000619429 290 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC093323.3-201ENST00000632627 949 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 VTI1BP2-201ENST00000394154 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 LINC01849-201ENST00000414647 517 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 HUS1-202ENST00000432325 1125 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC093871.1-201ENST00000503815 534 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 NT5CP2-201ENST00000553305 561 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC011472.2-201ENST00000586356 655 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC003005.2-201ENST00000595422 539 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 MYO5BP1-201ENST00000610994 1239 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 TTYH2-201ENST00000269346 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XIRP2A4UGR9 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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