Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CUL4BQ13620 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 LIN28B-203ENST00000637759 2635 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CUL4BQ13620 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CUL4BQ13620 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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