Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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PTPRJQ12913 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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