Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
E2F1Q01094 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
E2F1Q01094 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms