Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OR4C46-201ENST00000328188 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GMPR2-224ENST00000559910 1562 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
RPS29P62273 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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