Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC17Q9NP64 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms