Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC008940.1-201ENST00000438117 785 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 BTNL8-207ENST00000511704 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC138956.2-201ENST00000512934 528 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 APOC1P1-202ENST00000571466 253 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 KRTAP4-9-202ENST00000617453 558 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 CDC16-201ENST00000252457 2034 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 CDC16-205ENST00000375308 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 IL1RAP-210ENST00000434491 1565 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PSMC1P1-201ENST00000478110 1320 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 TREM2-201ENST00000338469 860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 LINC00877-202ENST00000464271 552 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC091027.2-201ENST00000578030 179 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 APTX-215ENST00000468275 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 IGLV1-44-201ENST00000390297 467 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AP001610.1-201ENST00000411427 1116 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AL031575.1-201ENST00000416609 845 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AL590302.2-201ENST00000435810 1122 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 DTNBP1-204ENST00000462989 1010 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AL133372.2-202ENST00000549360 768 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC015563.2-201ENST00000579580 772 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 LINC01651-201ENST00000624642 350 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM208BQ5VWN6 APH1B-203ENST00000380343 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms