Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SH3BP2P78314 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms