Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms