Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 STMN1-206ENST00000455785 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LAMP2-201ENST00000200639 1867 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMPOP42166 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMPOP42166 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms