Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
VPREB1P12018 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms