Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms