Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TMPOP42166 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms