Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MLH1P40692 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MLH1P40692 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MLH1P40692 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MLH1P40692 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms