Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RAB7B-201ENST00000617070 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RN7SKP297-201ENST00000411270 282 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TACC1-211ENST00000520973 2564 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AOC2-201ENST00000253799 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZNHIT6-201ENST00000370574 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CTCFL-202ENST00000371196 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ELP2-202ENST00000351393 2453 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL355482.1-201ENST00000411509 2463 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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