Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 OPRM1-211ENST00000518759 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 EPM2A-214ENST00000638783 801 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 EPM2A-229ENST00000640980 647 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLD1P28340 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL008719.1-201ENST00000430449 473 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MTND6P9-201ENST00000458075 519 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SMIM6-202ENST00000579469 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLD1P28340 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms