Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL42Q9Y6G3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MRPL42Q9Y6G3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms