Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKP3Q9Y446 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PKP3Q9Y446 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms